Menudo enredo, deberías comentar más sobre ese proyecto, pero de entrada te voy a recomendar que leas .

hldi dijo:

que hacer para que los correos se encripten y los servidores no lo pongan en spam.

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Para que los correos se encripten debes usar GPG o Autocrypt que para el caso lo hace más automatizado, aunque esto no tiene nada que ver con que tu servidor sea marcado como SPAM.